Lấy bối cảnh sau các sự kiện trong series TV, Kamen Rider Gavv: Quân Xâm Lược Ngôi Nhà Bánh Kẹo mở màn khi Shoma và Sachika bất ngờ chạm trán một cánh cửa bí ẩn xuất hiện ngay trước mặt. Bị hút qua cánh cửa, Shoma rơi vào một thế giới tưởng như hoàn hảo: không còn Dark Treats (những “đồ ngọt hắc ám”) phá hoại con người, mọi thứ yên bình đến lạ. Ở đó vẫn tồn tại Hapipare - cửa hàng bánh kẹo quen thuộc, nhưng người sở hữu sức mạnh Gavv tại thế giới này lại là một chàng trai trẻ tên Taorin, người đã đánh mất toàn bộ ký ức quá khứ của mình. Từ đây, Kamen Rider Gavv: Invaders of the House of Snacks xoay quanh hành trình Shoma hợp tác với Taorin để khôi phục ký ức và tìm hiểu bí mật đằng sau thế giới “ngọt ngào nhưng bất thường” này. Trong lúc đó, một kẻ lạ mặt tự xưng là Caries bắt đầu tấn công thị trấn không phân biệt mục tiêu, biến vùng đất vốn thanh bình thành nơi hỗn loạn. Dấu vết dẫn Shoma, Taorin và đồng đội đến một Ngôi Nhà Bánh Kẹo khổng lồ - trung tâm của mọi âm mưu. Tại đây, Caries sử dụng một Gochizo chưa từng thấy để biến thân, sở hữu nguồn sức mạnh áp đảo khiến Kamen Rider Gavv bị dồn vào chân tường.